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miRNA表达谱检测
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服务概述
miRNA(microRNA)是一类长度约为20-24nt 的内源性非编码RNA,广泛参与基因转录后调控活动,其中多数miRNA具有高度序列保守性、表达时序性和组织特异性。近的研究表明,miRNA参与了各种各样的调节途径,包括细胞增殖与凋亡、生长发育、器官形成、造血过程、脂肪代谢、病毒防御等各种功能,具有重要的基因表达调控作用。
现在主流的芯片平台是Agilent和Affymetrix,Agilent只检出成熟体,而Affymetrix的芯片前体和成熟体皆检出,假阳性率较高,但Affymetrix的容量相比Agilent的大很多。我们可提供Agilent和Affymetrix平台的microarray筛选服务及后续的芯片数据分析及靶基因聚类分析。
miRNA表达谱芯片数据标准分析:
  • 表达差异分析:对于使用参照实验设计进行的重复实验, 可以对多个样本的基因表达数据进行差异基因表达分析, 具体方法包括差异倍数分析、t检验等。
  • 聚类分析:聚类分析是通过建立各种不同的数学模型,把基于相似数据特征的变量或样本组合在一起。归为一个簇的基因在功能上可能相似或关联,从而找到未知基因的功能信息或已知基因的未知功能。
miRNA表达谱芯片数据分析:
  • miRNA靶基因预测及信号通路分析:靶基因预测是miRNA功能研究上的有力工具。通过对多个数据库的靶基因预测结果统计,可以进一步缩小靶基因范围,为实验验证提供指导。结合基因表达谱芯片检测结果,可以更有效地分析miRNA靶基因。
  • miRNA靶基因调控网络构建:miRNA在细胞内具有多种重要的调节作用。一个miRNA可能有多个靶基因,而一个基因很可能受多个miRNA的调控。miRNA调控多个基因的表达,也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某个基因的表达。针对客户感兴趣的若干个特定miRNA,运用生物信息学的方法和技术通过文献挖掘研究复杂的miRNA调控网络关系,揭示有关的作用机理。
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